L'association a pour origine un petit groupe d'habitants de Mortagne et ses environs qui avait déjà commencé à œuvrer à titre personnel et a eu envie de fédérer toutes ces initiatives individuelles et de faire grandir les valeurs de la transition dans la région. Le projet s'est construit en partenariat avec le cinéma Etoile de Mortagne ou a été projeté en mai 2017 "Qu'est ce qu'on attend", film de M-M Robin sur Ungersheim, une ville en transition. La population a été invité à venir découvrir les villes en transition, et à laisser ses coordonnées pour pouvoir ensuite se réunir et créer les bases de l'asso. La salle était comble, la réunion publique qui a suivi a remporté beaucoup de succès. À ce moment 4 ateliers ont été lancé : la grainothèque, le verger partagé, les incroyables comestibles et le SEL. A l'issue de la première année Mortagne en transition comptait plus de 100 adhérents.

Les adhérents sont informés de toute l'activité de l'association. Ils peuvent participer au SEL et à tous les groupes de travail, de manière ponctuel ou régulière. Sympathisants, vous recevez les informations publiques, vous participez aux différents événements. L'association est coordonnée par le groupe noyau qui est le garant de l'esprit des villes en transition et anime l'association.

Mortagne en transition  participe à mettre les gens en relation, elle permet une éducation populaire et devient un interlocuteur pour les collectivités locales.